nofollow にすることによって、クローラーがその先に行かないようにします。
たとえば、他社のサイトやログイン後のサイトはクロールしなくていいので、
noollow属性を指定し検索エンジンがクロールしないようにします。
上位表示したいページへのクロール頻度があがったり、より正確にインデックスされるので、ランキングにも影響がでてきます。
Googleは、SEOに影響があるリンクの売買を禁止しています。
たとえば以下のようなことがあります。
このようなリンクには、nofollowがないとペナルティーを受けてしまうことになります。
<a href="http://www.siteB.net/" rel="nofollow">サイトBへのリンク</a>
metaタグにnofflollowを設定すると、ページ内にある全てのリンクに対しnofollowを指定するのと同じになります。
<meta name="robots" content="nofollow">